СВІДЧЕННЯ ІСНУВАННЯ ХРОМАТИНУ В СТАНІ ФРАКТАЛЬНОЇ ГЛОБУЛИ ЗА ДАНИМИ КОМЕТНОГО ЕЛЕКТРОФОРЕЗУ

Анотація

Дослідження просторової організації інтерфазного хроматину методом картування контактів між окремими геномними локусами з розділенням у кілька мільйонів пар нуклеотидів свідчать, що конформація хроматинової фібрили відповідає стану фрактальної глобули. Такий стан характеризується певними закономірностями щодо ймовірності утворення контактів між віддаленими локусами, а контакти, у свою чергу, приводять до появи петельних доменів. У роботі досліджуємо кінетику виходу петель ДНК при кометному електрофорезі та розмір петельних доменів, що мігрують. Отримані результати щодо розподілу довжини петельних доменів, розміром до 100 тисяч пар нуклеотидів,  узгоджуються зі структурою фрактальної глобули. Отже, така модель організації хроматину є також справедливою для менших масштабів – на рівні кількох тисяч пар нуклеотидів. 

КЛЮЧОВІ СЛОВА: фрактальна глобула, петельні домени ДНК, кометний електрофорез.