ВПЛИВ ДНК-ІНТЕРКАЛЯТОРІВ НА СТАБІЛЬНІСТЬ ПЕТЕЛЬНИХ ДОМЕНІВ ДНК

Анотація

Петельні домени ДНК – основний компонент структури інтерфазного хроматину на вищих рівнях його організації – задіяні у багатьох функціональних процесах, що відбуваються в ядрі (транскрипція, її регуляція, реплікація та репарація ДНК). Дуже важливим є розуміння механізмів формування та стабілізації петель ДНК – взаємодій між ДНК і білками, які беруть у цьому участь, що на сьогоднішній день залишається досить погано вивченим. У нашій роботі ми зосередили увагу на дослідженні організації та особливостей стабілізації петельних доменів розміром до 200 тисяч пар нуклеотидів за допомогою методу кометного електрофорезу. Отримані результати показують, що при використанні високих концентрацій інтеркалюючого агента хлорокіну відбувається порушення ДНК-білкових взаємодій, які фіксують основи петель ДНК, що призводить до реорганізації хроматину і суттєво впливає на ефективність міграції ДНК під час електрофорезу. Однак така дестабілізація є оборотною: після припинення впливу інтеркалятора більшість взаємодій може відновлюватися. Наші результати узгоджуються з моделлю фіксації петельних доменів ДНК за допомогою комплексу білків CTCF та когезину.