ГОМОЛОГИ ПЛЕЙОТРОПНОГО РЕГУЛЯТОРНОГО ГЕНА adpA В ACTINOPLANES: АНАЛІЗ IN SIILICO

Анотація

Actinoplanes teichomyceticus продукує глікопептидний антибіотик тейкопланін, що є антибіотиком “ останньої лінії оборони” проти мультирезистентних коків. Кластер ге нів біосинтезу тейкопланіну (tcp) клоновано 8 років тому, хоча регуляція продукції цього антибіотика погано зрозуміла внаслідок браку розроблених методів генетичних маніпуляцій цим видом, а також відсутності даних про будову генома A. teichomyceticus. У стрептоміцетів регуляторний ген adpA кодує один із ключових регуляторів вторинного та первинного метаболізму, а також морфогенезу, формуючи найбільший на сьогодні генний “модулон”, що описано у бактерій. Ми проаналізували гіпотезу про те, що AdpA-подібний білок може бути задіяно у реуляції продукції тейкопланіну. Використовуючи описану консенсусну операторну послідовність AdpA для стрептоміцетів, ми здійснили пошук відповідних операторів у tcp-кластері. Виявлено кілька імовірних операторів AdpA, що вказує на те, що AdpA-залежна регуляція може функціонувати в Actinoplanes. З використанням низки методів порівняльної геноміки виявлено кілька гомологів adpA у повністю просеквенованих геномах Actinoplanes, а також у чорновій послідовності генома A. teichomyceticus. У сумі наші дані узгоджуються з припущенням, що adpA-залежна регуляція впливає на продукцію антибіотиків не тільки в роді Streptomyces, але й у роді Actinoplanes.