ВИВЧЕННЯ ГЕНІВ STREPTOMYCES GHANAENSIS ATCC14672 SSFGH_03627 ТА SSFGH_01411, ЩО КОДУЮТЬ ІМОВІРНІ МЕМБРАННІ БІЛКИ
Анотація
Streptomyces ghanaensis ATCC14672 – продуцент моеноміцину А, фосфогліколіпідного антибіотика, що діє на бактерійні пептидогліканові глікозилтрансферази (PGTs). Генетичні та біохімічні аспекти синтезу молекули моеноміцину залишаються не цілком зрозумілими. Досі невідомо, як моеноміцини транспортуються назовні з клітини, і чи може активний транспорт моеноміцину бути важливим для набуття резистентності продуцента до власного потенційно токсичного вторинного метаболіта. Спостерігається загальна структурна і функціональна подібність між моеноміцином і ліпідом II – життєво важливим попередником пептидоглікану (схожа ліпідно-глікозидна основа, обидва зв’язують PGTs). Ми припускаємо, що продукти гена(ів), задіяні у транспорті ліпіду II через мембрану S. ghanaensis ATCC14672, аналогічно до MurJ Escherichia coli, можуть брати участьі в експорті моеноміцину. У цій роботі ми виконали початкову генетичну характеристику двох ідентифікованих нами murJ-подібних генів S. ghanaensis ATCC14672, а саме SSFG_03627 і SSFG_01411. Ген SSFG_03627 – життєво важливий, і його може бути делетовано з генома S. ghanaensis ATCC14672 тільки за наявності додатково внесеної копії гена SSFG_03627. Спроби комплементувати murJ-дефектний штам E. coli NR1154 вищезгаданими генами S. ghanaensis були невдалими. Маніпуляції з числом копій гена SSFG_03627 мали складний вплив на продукцію моеноміцину в S. ghanaensis ATCC14672.
Повний текст:
PDF (English)Посилання
Bilyk B., Luzhetskyy A. Unusual site-specific DNA integration into the highly active pseudo-attB of the Streptomyces albus J1074 genome // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2014. Vol. 98. P. 5095–104. https://doi.org/10.1007/s00253-014-5605-y
Dereeper A., Guignon V., Blanc G. et al. Phylogeny.fr: robust phylogenetic analysis for the non-specialist // Nucleic Acids Res. 2008. Vol. 36. P. 465–469. https://doi.org/10.1093/nar/gkn180
Gampe C. M., Tsukamoto H., Wang T. S. et al. Modular synthesis of diphospholipid oligosaccharide fragments of the bacterial cell wall and their use to study the mechanism of moenomycin and other antibiotics // Tetrahedron. 2011. Vol. 67. P. 9771–9778. https://doi.org/10.1016/j.tet.2011.09.114
Gust B., Chandra G., Jakimowicz D. et al. Lambda red-mediated genetic manipulation of antibiotic-producing Streptomyces // Adv. Appl. Microbiol. 2004. Vol. 5. P. 107–128. https://doi.org/10.1016/S0065-2164(04)54004-2
Kieser T., Bibb M. J., Buttner M. J. et al. Practical Streptomyces Genetics. Norwich: John Innes Foundation. 2000. 634 p.
Koshla O., Lopatniuk M., Rokytskyy I. et al. Properties of Streptomyces albus J1074 mutant deficient in tRNA(Leu)(UAA) gene bldA // Arch. Microbiol. 2017. May 20. doi: 10.1007/s00203-017-1389-7. https://doi.org/10.1007/s00203-017-1389-7
Ostash B., Campbell J., Luzhetskyy A., Walker S. MoeH5: a natural glycorandomizer from the moenomycin biosynthetic pathway // Mol. Microbiol. 2013. Vol. 90. P. 1324–38. https://doi.org/10.1111/mmi.12437
Ostash B., Doud E.H., Lin C. et al. Complete characterization of the seventeen step moenomycin biosynthetic pathway // Biochem. 2009. Vol. 48. P. 8830–8841. https://doi.org/10.1021/bi901018q
Ruiz N. Lipid Flippases for Bacterial Peptidoglycan Biosynthesis // Lipid Insights. 2016. Vol. 13. P. 21–31.
Sambrook J., Russell D. W. Molecular cloning: a laboratory manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory. 2001. 450 p.
Siegl T., Luzhetskyy A. Actinomycetes genome engineering approaches // Antonie Van Leeuwenhoek. 2012. Vol. 102. P. 503–16. https://doi.org/10.1007/s10482-012-9795-y
DOI: http://dx.doi.org/10.30970/vlubs.2017.76.05
Посилання
- Поки немає зовнішніх посилань.
