МОЛЕКУЛЯРНА БУДОВА Е-ГЕНІВ CОЇ ТА ЇХНІ ФУНКЦІОНАЛЬНІ МУТАЦІЇ

O. Okhrymovych, S. Chebotar, G. Chebotar, D. Zharikova

Анотація


Розглянуто особливості молекулярної структури відомих Е-локусів (early maturity) та їхньої участі в передачі сигналів до зацвітання рослин, залежно від чутливості генотипів сої до фотоперіоду. Ці локуси сприяють адаптації рослин до широкого діапазону природних умов за рахунок мутацій у генах і QTL, що контролюють час цвітіння. На молекулярному рівні Е-гени суттєво різняться за структурними особливостями, походженням і функціями. Розміри ідентифікованих генів коливаються від одного екзону 525 п.н., кодуючого транскрипційний фактор (Е1), до 14 екзонів і близько 20 т.п.н. для гена GmGIa (Е2). Серед фукціональних мутацій, які в більшості призводять до часткової або повної втрати функції, наявні однонуклеотидні заміни або делеції, вставки послідовностей, схожих на транспозони, які, у свою чергу, можуть призводити до заміни амінокислот у білку, до зсуву рамки зчитування, до появи передчасного стоп-кодона. Продукти Е-генів є рецепторами сигналів, що надходять із навколишнього середовища, та беруть участь у сигнальних шляхах, які контролюють фотоперіод.
Загальний вплив і взаємодії між Е-генами наразі у повному обсязі не вивчено, молекулярну будову досліджено лише для Е1-Е4, для них запропоновано генетичну мережу взаємодій, водночас п’ять локусів (Е6-Е9 та Е11) є лише картованими на хромосомах сої, а наявність окремого локусу Е5 досі не доведено. У восьми з 11 E-локусів домінантний алель спричиняє пізнє зацвітання. Відомо про плейотропний вплив алелів Е-генів на урожайність, висоту рослини, стресостійкість, реакцію на знижені температури. Знання алельного стану лише окремих із 11 генів є недостатнім. Необхідне комплексне розуміння функціонування генетичної мережі фотоперіодичної відповіді, тому що Е-гени є генетичними детермінантами, на які можна орієнтуватися під час селекції та створення нових сортів із запрограмованими темпами розвитку.


Ключові слова


соя; Е-гени; фотоперіодична чутливість; строки стиглості

Повний текст:

PDF

Посилання


Bernard R. L. Two major genes for time of flowering and maturity in soybeans // Crop Science. 1971. Vol. 11. P. 242-247.
https://doi.org/10.2135/cropsci1971.0011183X001100020022x

Bonato E. R., Vello N. A. E6, a dominant gene conditioning early flowering and maturity in soybeans // Genet. Mol. Biol. 1999. Vol. 22. P. 229-232.
https://doi.org/10.1590/S1415-47571999000200016

Cao D., Takeshima R., Zhao C. et al. Molecular mechanisms of flowering under long days and stem growth habit in soybean // J. Exp. Bot. 2017. Vol. 68. N 8. P. 1873-1884

Cober E. R., Molnar S. J., Charette M., Voldeng H. D. A new locus for early maturity in soybean // Crop Sci. 2010. Vol. 50. P. 524-527.
https://doi.org/10.2135/cropsci2009.04.0174

Cober E. R., Voldeng H. D. A new soybean maturity and photoperiod-sensitivity locus linked to E1, and T // Crop Sci. 2001. Vol. 41. N 3. P. 698-701.
https://doi.org/10.2135/cropsci2001.413698x

Destro D., Carpentieri-Pípolo V., Kiihl R. A. S., Almeida L. A. Photoperiodism and genetic control of the long juvenile period in soybean: A review // Crop Breed. Appl. Biotechnol. 2001. Vol. 1. P. 72-92.
https://doi.org/10.13082/1984-7033.v01n01a10

Dissanayaka A., Rodriguez T. O., Di S. Quantitative trait locus mapping of soybean maturity gene E5 // Breed Sci. 2016. Vol. 66. N 3. P. 407-415.
https://doi.org/10.1270/jsbbs.15160

Funatsuki H., Kawaguchi K., Matsuba S., Sato Y., Ishimoto M. Mapping of QTL associated with chilling tolerance during reproductive growth in soybean // Theor. Appl. Genet. 2005. Vol. 111. P. 851-861.
https://doi.org/10.1007/s00122-005-0007-2

Garner W. W., Allard H. A. Effect of the relative length of day and night and other factors of the environment on growth and reproduction in plants // J. Agric. Res. 1920. Vol. 18. P. 553-606.

Kong F., Nan H., Cao D. et al. New Dominant gene E9 conditions early flowering and maturity in soybean // Crop Science. 2014. Vol. 54. P. 2529-2535.
https://doi.org/10.2135/cropsci2014.03.0228

Kong F.J., Liu B., Xia Z. Two coordinately regulated homologs of FLOWERING LOCUS T are involved in the control of photoperiodic flowering in soybean // Plant Physiol. 2010. Vol. 154. P. 1220-1231.
https://doi.org/10.1104/pp.110.160796

Koornneef M., Alonso-Blanco C., Blankestijn-de Vries H. et al. Genetic interactions among late-flowering mutants of Arabidopsis // Genetics. 1998. Vol. 148. N 2. P. 885-892.

Langewisch T., Zhang H., Vincent R. et al. Major soybean maturity gene haplotypes revealed by SNPViz analysis of 72 sequenced soybean genomes // PLOS ONE. 2014. Vol. 9. N 4. P. e94150. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0094150

Li X., Fang C., Xu M. et al. Quantitative trait locus mapping of soybean maturity gene E6 // Crop Science. 2017. Vol. 57. N 5. P. 1-8. https://doi.org/10.2135/cropsci2017.02.0106

Liu B., Kanazawa A., Matsumura H. et al. Genetic redundancy in soybean photoresponses associated with duplication of phytochrome A gene // Genetics. 2008. Vol. 180. P. 995-1007. https://doi.org/10.1534/genetics.108.092742

Lukashin A.V., Borodovsky M. GeneMark, new solutions for gene finding // Nucleic Acids Res. 1998. Vol. 26. N 4. P. 1107-1115. https://doi.org/10.1093/nar/26.4.1107

McBlain B. A., Bernard R. L. Anewgene affecting the time of flowering maturity in soybeans // J. Hered. 1987. Vol. 178. P. 68-70.

Mizoguchi T., Wright L., Fujiwara S. et al. Distinct roles of GIGANTEA in promoting flowering and regulating circadian rhythms in Arabidopsis // Plant Cell. 2005. Vol. 17. N 8. P. 2255-2270. https://doi.org/10.1105/tpc.105.033464

Molnar S. J., Rai S., Charette M., Cober E. R. Simple sequence repeat (SSR) markers linked to E1, E3, E4, and E7 maturity genes in soybean // Genome. 2003. Vol. 46. P. 1010-1024. https://doi.org/10.1139/g03-079

Samanfar B., Molnar S. J., Charette M. et al. Mapping and identification of a potential candidate gene for a novel maturity locus, E10, in soybean // Theor. Appl. Genet. 2017. Vol. 130. N 2. P. 377-390. https://doi.org/10.1007/s00122-016-2819-7

Schmutz J. Genome sequence of the palaeopolyploid soybean // Nature. 2010. Vol. 463. P. 178-183.

Swaminathan K., Peterson K., Jack T. The plant B3 superfamily // Trends Plant Sci. 2008. Vol. 13. N 12. P. 647-55. https://doi.org/10.1016/j.tplants.2008.09.006

Tsubokura Y., Matsumura H., Xu M. et al. Genetic variation in soybean at maturity locus E4 is involved in adaptation to long days at high latitudes // Agronomy. 2013. Vol. 3. P. 117-134. https://doi.org/10.3390/agronomy3010117

Tsubokura Y., Watanabe S., Xia Z. et al. Natural variation in the genes responsible for maturity loci E1, E2, E3 and E4 in soybean // Ann. Bot. 2014. Vol. 113. N 3. P. 429-441. https://doi.org/10.1093/aob/mct269

Wang F., Nan H., Chen L. et al. A new dominant locus, E11, controls early flowering time and maturity in soybean // Mol. Breeding. 2019. Vol. 39. P. 70. https://doi.org/10.1007/s11032-019-0978-3

Watanabe S., Hideshima R., Xia Z. Map-based cloning of the gene associated with the soybean maturity locus E3 // Genetics. 2009. Vol. 182. P. 1251-1262. https://doi.org/10.1534/genetics.108.098772

Watanabe S., Xia Z., Hideshima R. A map-based cloning strategy employing a residual heterozygous line reveals that the GIGANTEA gene is involved in soybean maturity and flowering // Genetics. 2011. Vol. 188. P. 395-407. https://doi.org/10.1534/genetics.110.125062

Xia Z., Watanabe S., Yamada T. Positional cloning and characterization reveal the molecular basis for soybean maturity locus E1 that regulates photoperiodic flowering // Proc. Nat. Acad. Sсi., USA. 2012. Vol. 109. P. E2155-E2164. https://doi.org/10.1073/pnas.1117982109

Yamasaki K., Kigawa T., Inoue M. et al. Solution structure of the B3 DNA binding domain of the Arabidopsis cold-responsive transcription factor RAV1 // Plant Cell. 2004. Vol. 16. N 12. P. 3448-3459. https://doi.org/10.1105/tpc.104.026112

Zharikova D. O., Chebotar G. O., Aksonova O. A., Chebotar S. V. Vyznachennia alelnoho stanu heniv E1, E2, E3, E4 ta E7 za dopomohoiu zcheplenykh z nymy mikrosatelitnykh lokusiv u sortiv soi suchasnoi selektsii // Ekoloho-henetychni aspekty v selektsii polovykh kultur v umovakh zmin klimatu: Materialy mizhnarodnoi naukovo-praktychnoi konferentsii, prysviachenoi 90-richchiu z dnia narodzhennia henetyka, selektsionera, profesora M.M. Chekalina (18-19 kvitnia 2019 r.) / Poltavska derzhavna ahrarna akademiia. Poltava, 2019. P. 29.

Zharikova D., Chebotar G., Aksyonova E. et al. Polymorphism in SSR-loci associated with E genes in soybean mutant lines perspective for breeding // Agricultural science and practice. 2019. Vol. 6 (3). Р. 45-55. https://doi.org/10.15407/agrisp6.03.045




DOI: http://dx.doi.org/10.30970/vlubs.2020.82.01

Посилання

  • Поки немає зовнішніх посилань.